No se conoce con exactitud la fecha de construcción del templo, pero una pintura que se encuentra en el interior hace suponer que fue en 1730.[1]​ Sin embargo, los planes de su construcción se remontan al siglo XVI, cuando la orden franciscana se estableció en el lugar para fundar un pequeño convento.[2]​ En 1560 los franciscanos iniciaron un templo en el mismo sitio, aunque la edificación del templo actual comenzó hasta la segunda mitad del siglo XVII, extendiéndose hasta el siglo XVIII.[3]​

 Altar mayor de la iglesia de San Francisco Acatepec, ca. 1913. Fotografía de Gullermo Kahlo.

El templo, junto con otros que se encuentran en Puebla y fueron construidos entre los siglos XVII y XVIII se caracterizan por las fachadas policromadas de talavera y ladrillo rojo. La cerámica del templo fue elaborada a mano entre los años 1650 y 1750, época en que la talavera poblana se convirtió en parte de la decoración principal de los edificios del barroco.[4]​

El 31 de diciembre de 1939 sufrió un incendio en el interior,[5]​ sin embargo, fue restaurado íntegramente gracias a la existencia de documentos fotográficos que había realizado Guillermo Kahlo a principios del siglo XX junto con Gerardo Murillo de diversos templos religiosos de México.[2]​[3]​[6]​ Luego del incendio, la decoración del interior fue reconstruida por la familia cholulteca Pantle, quienes se dedicaban a la yesería; dicho trabajo de restauración duró 25 años.[7]​ Terán Bonilla señala, sin embargo, que el programa iconográfico fue modificado substancialmente durante la reconstrucción; incluso los considera como errores.[5]​

En 1946, el director Emilio Fernández eligió el templo de San Francisco Acatepec como una de las locaciones para la película Enamorada, protagonizada por María Félix y Pedro Armendáriz.[8]​[9]​

↑ Toussaint, Manuel (1 de enero de 1962). Arte colonial en México. Impr. Universitaria. Consultado el 18 de septiembre de 2016.  ↑ a b «San Francisco Acatepec – El Corazón del Barroco parte 2». vivedeviaje.com.mx. Archivado desde el original el 8 de octubre de 2016. Consultado el 19 de septiembre de 2016.  ↑ a b «San Francisco Acatepec». Ayuntamiento de San Andrés Cholula. Archivado desde el original el 17 de julio de 2019. Consultado el 19 de septiembre de 2016.  ↑ Subterráneos, Elizabeth Vázquez. Fotos: Emmanuel Roldán /. «Del arte barroco mexicano: San Francisco Acatepec y Santa María Tonantzintla - Subterráneos | Cultura Rock y Otras Alternativas desde Puebla». Archivado desde el original el 12 de octubre de 2019. Consultado el 18 de septiembre de 2016.  ↑ a b Terán Bonilla, 2006, p. 169. ↑ Toussaint y Murillo, 1924. ↑ Sánchez Fernández, Luis Enrique. «Iglesia de San Francisco Acatepec | Wikipuebla». www.wikipuebla.poblanerias.com. Archivado desde el original el 15 de marzo de 2016. Consultado el 12 de diciembre de 2018.  ↑ Azcatl, Joel (16 de abril de 2014). «Enamorados de Cholula». Revista Esnob. Autores, no autoridades. Archivado desde el original el 10 de junio de 2016. Consultado el 9 de enero de 2020.  ↑ Itzmoyotl Ramos, Amelia (2007). «Patrimonio artístico y cultural. Devoción e identidad en San Francisco Acatepec (1940-1967)». Tesis de la Licenciatura en Historia de la Benemérita Universidad Autónoma de Puebla. Archivado desde el original el 2 de octubre de 2016.