Mnajdra (maltesisk: L-Imnajdra) er et megalittisk tempelkompleks funnet på den sørlige kysten av middelhavsøya Malta. Mnajdra ligger ca. 500 m fra Ħaġar Qim-komplekset og ble bygget en gang på 3000-tallet f.Kr. De megalittiske templene på Malta er blant de eldste religiøse stedene på Jorden, beskrevet av UNESCOs komite for verdensarven som «unik arkitektoniske mesterverk». I 1992 anerkjente UNESCO byggverkene ved Mnajdra og fire andre megalittiske strukturer på Malta som en del av verdensarven. I 2009 var arbeidet for å beskyttet Mnajdra under et tak fullført.

Mnajdra er lokalisert på et ulendt strekning av Maltas sørkyst med utsyn over den lille, ubebodde øya Fifla. Mnajdra ligger rundt 500 meter fra templene på Ħaġar Qim og består av tre templer vendt mot en felles oval forgård. Den første og eldste strukturen er datert til Ġgantija-fasen, 3600–3200 f.Kr. Det andre byggverket var det sørlige tempelet, bygget i tidlig Tarxien-fase, 3150–2500 f.Kr. Det siste templet som ble bygget, det sentrale tempelet, ble reist opp mellom de to andre.