Dopo che il vecchio municipio fu distrutto nel grande incendio del 1842, ci vollero quasi 44 anni per costruirne uno nuovo. L'edificio attuale fu progettato da un gruppo di sette architetti, guidati da Martin Haller. La costruzione iniziò nel 1886 e il nuovo municipio fu inaugurato nel 1897. Il suo costo fu di 11 milioni di marchi tedeschi d'oro, circa 80 milioni di euro. Il 26 ottobre 1897, in occasione della cerimonia ufficiale di apertura, il primo sindaco Johannes Versmann ricevette le chiavi del municipio.[1]

Nel dopoguerra, diversi capi di Stato hanno visitato Amburgo e il suo municipio, tra cui l'imperatore Hailé Selassié I, lo Sha Mohammed Reza Pahlavi nel 1955 e la regina Elisabetta II nel 1965. Sulla piazza del mercato si tenne una commovente cerimonia di commemorazione per le vittime dell'alluvione del Mare del Nord del 1962. Momenti più felici sono stati i festeggiamenti dell'Hamburger SV come campione di calcio tedesco, l'ultima volta però nel 1983.[1][2]

Nel 1971 una stanza della torre fu scoperta solo accidentalmente durante la ricerca di un documento caduto dietro uno schedario. È quindi probabile che ci siano ancora più stanze delle 647 attualmente contate.[3]