Pelabuhan Hamburg (bahasa Jerman: Hamburger Hafen) adalah pelabuhan yang terletak di Sungai Elbe di Hamburg, Jerman. Jaraknya 110 kilometer dari muara sungai yang berbatasan langsung dengan Laut Utara.

Pelabuhan terbesar di Jerman ini, berjuluk "Gerbang Menuju Dunia" atau dalam bahasa Jerman disebut Tor zur Welt. Dalam hal bongkar muat peti kemas, pelabuhan ini adalah pelabuhan tersibuk ketiga di Eropa (setelah Pelabuhan Rotterdam dan Pelabuhan Antwerpen) dan terbesar ke 15 di dunia. Pada tahun 2014 telah dibongkar muat sebanyak 9,73 juta TEU (setara dengan peti kemas sepanjang 20 kaki) di pelabuhan ini.

Pelabuhan tersebut memiliki area total seluas 73,99 km². Dari total luas tersebut, seluas 43,31 km² digunakan sebagai lahan pelabuhan. Lokasi pelabuhan ini secara alami diuntungkan oleh kondisi dari Sungai Elbe yang bercabang, sehingga letaknya dianggap ideal bagi kegiatan bongkar muat dan pergudangan. Pelabuhan bebas ini dibangun ketika kota Hamburg bergabung dengan Serikat Pabean Jerman. Hal ini memungkinkan pengeksporan, pengimporan, dan penyimpanan muatan impor yang tanpa dikenakan bea cukai. Namun sistem pelabuhan bebas ini tidak berlaku lagi sejak tahun 2013.