St. Pauli pada awalnya berdiri bukan karena sepak bola, tetapi karena olahraga renang. Sepak bola mulai menjadi bagian dari St. Pauli pada 1907 dan secara resmi berdiri pada 15 Mei 1910. Pada masa Reich Ketiga, St. Pauli terkena dampak reorganisasi sepak bola oleh rezim Adolf Hitler, hal itu menyebabkan St. Pauli harus terdegradasi. St. Pauli kemudian kembali bermain di Gauliga (Divisi Utama Liga Jerman pada Masa Hitler) pada 1940 hingga berakhirnya Perang Dunia II.[1]

Setelah Perang Dunia II berakhir pada 1945, St. Pauli kemudian mengikuti kompetisi Oberliga Nord, kompetisi tertinggi sepak bola Jerman bagian Utara pasca-Nazi pada 1947. Pada 1963, St. Pauli mendapatkan promosi ke Bundesliga, tapi pada 1974, St. Pauli terdegradasi ke 2 Bundesliga, hingga hari ini.[1] Diarsipkan 2023-04-12 di Wayback Machine.