Al final del siglo XIX, Khndzoresk era el pueblo más grande de Armenia Oriental. A principios del siglo XX la comunidad alcanzó 8.300 habitantes (1.800 casas). En 1913 había 27 tiendas, 3 tenerías y 7 escuelas. El pueblo es famoso por participar en el movimiento de liberación de Davit Bek, uno de los héroes de Armenia que luchó contra otomanos y persas en el siglo XVIII. La fortaleza de Khndzoresk sirvió como base militar para Mkhitar Sparapet en 1728-1730, que preservó lo conquistado por Bek en Syunik, entonces Zangezur. En 1735 el pueblo fue visitado por el Catholicos (cabeza de la Iglesia apostólica armenia) Abraham Kretatsi, que dejó una minuciosa descripción de la comunidad en sus crónicas. En la década de 1980, se construyó un pueblo adicional a 7 km de Khndzoresk por razones políticas. Este pueblo, considerablemente más pequeño que Khndzoresk, es conocido como bajo Khndzoresk, o Nerkin Khndzoresk.