Erigida entre los años 848 y 851 la Gran Mezquita de Samarra fue por un tiempo la mezquita más grande del mundo. El califa al-Mutawakkil fue gran amante de la arquitectura, así que su gobierno tuvo un gran efecto en la apariencia de la ciudad, pues mandó construir esta mezquita y muchos otros palacios en todo Samarra.[1]​ La nueva Mezquita, con su minarete espiral, formaba parte de la extensión de la ciudad hacia el este, hacia el antiguo parque de caza[2]​; su minarete espiral fue considerado como una síntesis entre la torre-minarete islámica y el zigurat mesopotámico.[3]​

La mezquita fue destruida en el año 656 AH (1278 EC) tras la invasión de los mongoles de Hulagu Khan . Sólo siguen en pie el muro exterior y el minarete.[4]​

«La gran mezquita de Samarra se construyó durante el califato de al-Mutawakkil. Es la mezquita más grande del mundo. Construida íntegramente de ladrillos dentro de una pared flanqueada con torres, tiene un minarete de 55 m de altura con una rampa espiral que recuerda los zigurats de Mesopotamia». Henri Stierlin, Comprende l'Architecture universelle 2, pág. 347

El 1 de abril de 2005, la cima del minarete Malwiya resultó dañada por una bomba. Supuestamente, los insurgentes atacaron la torre porque las tropas estadounidenses la estaban usando como puesto de observación. Sin embargo, según Tony Blair en su testimonio de investigación a Irak del 21 de enero de 2011, los insurgentes habían atacado la mezquita para incitar a la violencia entre suníes y chiitas y desestabilizar el país. La explosión arrancó ladrillos de la cima del minarete y de su rampa espiral.[5]​

El 29 de abril de 2015 representantes de la UNESCO y los diplomáticos iraquíes Ahmed Abdulá Abed Abed y Ammar Himmeit Abdulhasan firmaron un acuerdo con el fin proteger la «Ciudad Arqueológica de Samarra» de la amenaza extremista, así como impulsar la restauración de la Gran Mezquita y del minarete de Al-Malwiyah.[6]​