São João da Pesqueira és un municipi portuguès, situat al districte de Viseu, a la regió del Nord i a la Subregió del Douro. L'any 2001 tenia 8.656 habitants. Es divideix en 14 freguesies. Limita al nord amb Alijó, al nord-est amb Carrazeda de Ansiães, a l'est amb Vila Nova de Foz Côa, al sud-est amb Penedono, al sud amb Sernancelhe, a l'oest amb Tabuaço i al nord-oest amb Sabrosa.