Iglesia de San Pedro Claver är en kyrka som ligger i Cartagena de Indias i Colombia. Denna kyrka och dess kloster ligger på Plaza de San Pedro Claver.

Kyrkan är en del av en uppsättning religiösa byggnader som kompletteras av San Pedro Claver-klostret och det arkeologiska museet. Det byggdes mellan 1580 och 1654, i spansk kolonialstil. Ursprungligen känd som kyrkan San Juan de Dios, har den kallats kyrkan San Ignacio de Loyola sedan 1622 och är nu känd som San Pedro Claver.

Kyrkan är kolonial, förutom kupolen, 1921 eliminerades den koloniala kupolen och den nuvarande kupolen restes, ett verk av franska Gaston Lelarge.

Vid dess altare ligger kvarlevorna av Sankt Peter Claver, som dog 1654 i Cartagena, efter att ha ägnat praktiskt taget allt hans liv till att evangelisera och förlösa de svarta slavarna i Nya Granada.

Den 7 maj 2022 invigde kyrkan formellt ett nytt mausoleum. Strukturen är i två våningar och använder befintligt utrymme som bor bakom helgonets viloplats. Mausoleumskonstruktionen donerades av filantroperna Dr Jaime Rodriguez Torres och Miami-investeraren Burt Connelly.