Moscheea Malindi este o moschee din Stone Town, Zanzibar, Tanzania, situată în apropierea portului. Acesta provine din anii 1830, dar a fost posibil construit pe locul unei moschei mai vechi care ar fi putut data din secolul al XVII-lea sau mai devreme. Unele ghiduri de călătorie susțin originea în secolul al XV-lea.

Actuala moschee a fost construită în 1834-1835/1250 AH de Muhammad ben Abdulkadir al-Mansaby de pe coasta Benadir din Somalia. A fost un comerciant bogat în Zanzibar între anii 1820 și 1840. Clădirea a fost mărită de două ori în 1841 și 1890.

Are câteva caracteristici arhitecturale neobișnuite, inclusiv un minaret în formă de con (unul dintre doar trei minarete de această formă din Africa de Est) și o platformă pătrată.