Prawdopodobnie już na przełomie epoki brązu i żelaza na wzgórzu znajdowała się pierwsza umocniona osada. Wraz z migracją ludów około szóstego stulecia na tereny te przybyli Frankowie. Na początku VIII wieku, na wzgórzu, wybudowany został kościół Najświętszej Marii Panny. Powołane zostało również biskupstwo Würzburga. Kościół ten jest najstarszą budowlą sakralną w Niemczech. Z początku tutejsi biskupi chowani byli na wzgórzu pod znajdującymi się tam płytami nagrobnymi. Poniżej wschodniego zbocza góry, od strony miasta, znajduje się kościół św. Burcharda. Jest to najstarszy kościół w Würzburgu, nazwany od imienia pierwszego biskupa.

Około 1200 roku wzgórze zostaje umocnione. Powstają mury obronne, wieża obserwacyjna, ośmiokątna studnia, pałac biskupa Konrada von Querfurt. W latach 1253–1719 twierdza Marienberg staje się rezydencją książąt biskupów z Würzburga.