La ville et le port de Garachico furent fondés juste après la conquête de Tenerife en 1496 par le banquier génois Christobal del Ponte. Dans le courant des XVIe et XVIIe siècles, Garachico devint le port le plus important de l'île.

En 1646 cent personnes furent tuées et quarante bateaux furent coulés lors d'un glissement de terrain.

La fin de la période faste de Garachico fut provoquée en 1706 par l'éruption d'un cratère secondaire du Teide, le mont Pico Viejo. Il n'y avait pas eu de morts mais la ville fut recouverte en grande partie de lave, le vignoble avoisinant fut détruit et le port fut rempli de lave. Après cet épisode les marchands se sont déplacés à Puerto de la Cruz.

En 1980, la mairie de Garachico reçoit la Médaille d'or du mérite des beaux-arts par le Ministère de l'Éducation, de la Culture et des Sports[1].