Burano est probablement habitée pour la première fois à l'époque romaine. Cependant, comme pour sa voisine Torcello, son développement commence après la chute de l'Empire romain d'Occident, au VIe siècle, lorsqu'elle est occupée par des personnes originaire d'Altinum. Bien que se développant rapidement, Burano est administrée depuis Torcello et ne bénéficie d'aucun des privilèges de cette île ou de Murano. Le nom de l'île fut à l'origine Boreana, une des portes d'Altinum.

L'importance de Burano s'accroit au XVIe siècle, lorsque des femmes de l'île commencent à fabriquer de la dentelle. Celle-ci est exportée à travers l'Europe, mais cette industrie commence à décliner au XVIIIe siècle.

Burano est une localité indépendante jusqu'en 1923, date à laquelle elle est rattachée à Venise en même temps que Murano et Pellestrina.