Interior de una de las cuevas.

La cueva fue descubierta por el naturalista Anton Posselt en 1879, quien ya entonces consiguió internarse aproximadamente 200 metros en la cueva. No pudo continuar ya que la capa de hielo era demasiado escarpada y su equipamiento era de mala calidad. El punto máximo que alcanzó lo marcó con una cruz negra sobre la piedra, conocida como Posselt-Kreuz (Cruz de Posselt). Después de esto la cueva quedó en el olvido.

En 1913 algunos científicos, entre ellos Alexander von Mörk, consiguieron superar la parte más empinada de la capa de hielo, conocida como Grossen Eiswall (La gran pared de hielo). Alexander von Mörk también fue el primer investigador que se aventuró a pasar por el pasaje Sturmsee, una pequeña galería cubierta de agua por aquel entonces. Una vez rebasada, descubrió una sala gigantesca que posteriormente recibiría su nombre. En 1914 Alexander fue llamado a filas y murió combatiendo en la Primera Guerra Mundial a la edad de 27 años. Su última voluntad fue que se le enterrara en Eisriesenwelt. Este deseo fue satisfecho y fue inhumado en el salón Alexander-von-Mörk-Dom que él mismo había descubierto.

Desde 1919 el abogado salzburgués Friedrich Oedl (1894-1969) fomentó la exploración de la cueva y estableció el primer alojamiento, das Forscherhüttl[1]. La Agencia para la Conservación de los Bosques Austriacos, Österreichischen Bundesforste, es la propietaria legal de Eisriesenwelt, pero la Asociación para la Espeleología (Verein für Höhlenkunde) de Salzburgo es la arrendataria provisional. En 1928 tras la creación de una sociedad de responsabilidad limitada propia (Eisriesenwelt-Gesellschaft m.b.H), cuyo presidente fue el Dr. Oedl, el acuerdo entre ambas entidades se convirtió en un contrato a largo plazo. Los ingresos que renta Eisriesenwelt son empleados en la exploración e investigación de la cueva. La Agencia para la Conservación de los Bosques Austríacos, como propietaria, recibe un porcentaje anual de los ingresos que se recaudan con las entradas.