Templo Longyin del pueblo de Chukou, en el área de Alishan.

La zona de Alishan estuvo originariamente poblada por la tribu tsou de aborígnes taiwaneses; el nombre deriva de la palabra aborigen Jarissang. Colonos de etnia china han se asentaron primero en las llanuras cerca de lo que hoy en día es Chiayi ya a finales de la dinastía Ming (alrededor de mediados del siglo XVII), pero no se trasladaron a las montañas hasta finales del siglo XVIII, estableciendo las ciudades de Ruili (瑞里), Ruifeng (瑞峰), Xiding (隙頂), y Fenqihu (奮起湖). Le siguieron encuentros armados entre los colonos y los aborígenes, en los que estos últimos se vieron obligados a internarse aún más adentro de las montañas.

Tras la cesión de Taiwán a Japón al final de la primera guerra sino-japonesa, las expediciones japonesas a la zona encontraron amplias cantidades de cipreses (檜木, o "hinoki" en japonés). Esto llevó al desarrollo de la industria de la tala en la zona y a la exportación de cipreses locales y madera de Taiwania. Se construyó una serie de ferrocarriles de vía estrecha en la zona en aquella época para facilitar el transporte de la madera desde las montañas hasta las llanuras que quedaban debajo, parte de los cuales siguen operando hoy en día como el ferrocarril forestal de Alishan. Empezaron a surgir nuevos pueblos a lo largo de las líneas de ferrocarril. También fue en esta época cuando los primeros turistas empezaron a visitar la zona. Se planeó entonces incorporar la zona al nuevo parque nacional Niitaka Arisan (新高阿里山国立公園).

Con el agotamiento de los recursos forestales en los años setenta, el turismo nacional y extranjero tomaron el relevo a la silvicultura como principal actividad económica de la zona. La industria turística siguió expandiéndose con la terminación de la autopista de Alisan en los años ochenta, desplazando al derrocarril como el principal medio de transporte a la montaña. Para combatir los problemas asociados con las crecientes multitudes de turistas y la expansión de las plantaciones de té y wasabi, la zona fue declarada paisaje protegido en 2001.

El 1 de diciembre de 2014, estalló un incendio en Alishan afectando a más de cinco hectáreas de tierra. La zona afectada se encontraba cerca del puente Tapang No. 3. Se cree que el fuego se debió a la sequedad del terreno que quedó vulnerable al fuego debido a la ausencia de lluvia en la zona durante meses.[1]​

↑ Focus Taiwan.tw