High Synagogue (τσεχικά: Vysoká synagoga) χρηματοδοτήθηκε από τον Mordechai Maisel και ολοκληρώθηκε το 1568, την ίδια χρονιά με την εβραϊκή πόλη Αίθουσα. Πιθανώς να διαμορφώθηκε σύμφωνα με την Υψηλή Συναγωγή της Κρακοβίας, η οποία χτίστηκε το 1556 στην Πολωνία. Το σπίτι σχεδιάστηκε από τον P. Roder σε αναγεννησιακό στυλ (επιβλέπων οικοδόμος ήταν ο κύριος Rada). Σχεδιάστηκε ως χώρος κηρύγματος για τους συμβούλους του εβραϊκού δημαρχείου. Στο κέντρο υπήρχαν bimah, περιτριγυρισμένα από καθίσματα. Ο Mordechai Maisel έδωσε κομμάτια Τορά και ασημένια εργαλεία στη συναγωγή. Η οροφή από γυψομάρμαρο ήταν γοτθικός θόλος με ραβδώσεις.

Το 1689 καταστράφηκε από τη Μεγάλη Πυρκαγιά. Η συναγωγή ανακατασκευάστηκε.

Το 1883 η συναγωγή ξαναχτίστηκε από τον J. M. Wertmüller. Κατά τη διάρκεια αυτής της τροποποίησης η πρόσοψη απλοποιήθηκε στη σύγχρονη εμφάνιση.

Το 1907 η ανατολική είσοδος έκλεισε και έγινε νέα είσοδος με θέα στην Κόκκινη Οδό (Červená ulice).

Άλλες ανακατασκευές έγιναν κατά τη διάρκεια του 1961, 1974–79 και 1982.

Κατά τη διάρκεια της ναζιστικής και κομμουνιστικής κυριαρχίας, η συναγωγή ήταν μέρος του Εβραϊκού Μουσείου και υπήρχε μια έκθεση παλαιών εβραϊκών βιβλίων.