Nach der Legende fand im 12. Jahrhundert ein Hirte an einem Wintertag unter einer blühenden Rose eine Madonnenstatue und nahm diese mit nach Hause. Die Statue kehrte jedoch dreimal an die gleiche Stelle zurück, an der er sie gefunden hatte. Schließlich beschlossen die Anwohner, dort eine Kapelle zu bauen und stellten die bemalte Statue in einer Altarnische auf.[1]

1873 erklärte der Generalrat der Täler die Schirmherrschaft des Landes über die Kapelle. Am 8. September 1921, dem Fest Mariä Geburt, wurde die Marienstatue gekrönt. Seitdem wird der Tag der Nostra Senyora de Meritxell als Nationalfeiertag des Fürstentums Andorra begangen.

Die ursprüngliche Kapelle war im romanischen Baustil errichtet und wurde im 17. Jahrhundert vollständig renoviert. 1972 fing das Heiligtum in der Nacht nach dem Nationalfeiertag Feuer und wurde völlig verwüstet.[2] Im Feuer wurde mit der Innenausstattung auch die romanische Schnitzerei der Jungfrau, die älteste des Fürstentums, vernichtet. Heute kann man in dem wiederhergestellten Teil des Gebäudes eine Ausstellung über die Geschichte des Ortes besichtigen.