Territori de Masisi és un territori situat a la província de Kivu Nord de la República Democràtica del Congo. La seva seu política es troba a la localitat de Masisi. El territori de Masisi ha estat constantment sotmès al conflicte entre l'exèrcit i les milícies congolès, que ha afectat l'est del Congo des del final de la Segona Guerra del Congo. les milícies originàries del genocidi de Ruanda i la guerra civil del Congo, i els grups rebels d'Uganda, estan implicades en aquests episodis de conflicte, que també es relaciona amb la seguretat fronterera de Rwanda i el control dels minerals de l'est del Congo per part de grups rebels i interessos empresarials. Els grups armats han atacat sistemàticament la població civil.

L'Hospital Masisi, dirigit per l'agència d'ajuda Metges Sense Fronteres, atén civils i combatents de tots els bàndols del conflicte. La ciutat és inaccessible bona part del temps, a causa dels combats, malgrat la presència de la missió de pau de les Nacions Unides coneguda com a MONUSCO.

El juliol de 2014, una ofensiva als territoris de Masisi i Walikale per part de l'exèrcit congolès i les forces de l'ONU va alliberar 20 ciutats controlades pels rebels, alliberant els residents locals.

El territori de Masisi té una àrea de 4734 km². Algunes de les llengües locals que es parlen són el francès, el suahili i el hunde.