苦行僧站在木板上横渡巴格马蒂河

寺庙的祭祀活动自马拉王亞克沙·馬拉（英语：Yaksha Malla）（Yaksha Malla）的时代开始[1]，祭司是来自南印度的婆罗门。此传统应该是在公元6世纪由圣人商羯罗开创，表面上是为了停止寺庙中很普遍的人祭，实际上是通过鼓励文化交流使大印度（Greater India）思想得到传播，使印度达到统一。他的方案在印度的其他寺庙中也被推行。与印度不同，那时尼泊尔的主权在几个世纪中从未被外敌夺走，這是由於她被强大的踞喀兵军队保护。然而马拉王很尊重商羯罗的请求，并任命其为受人尊敬的印度教祭司。

 帕舒帕蒂纳特庙

还有一种说法，该寺是印度祭司们的住所，因为当国王逝世后，尼泊尔全国的百姓一年中都不能进行任何宗教活动，而要为故王服丧一整年。由于寺庙必须永远受人敬仰，印度祭司也会进入寺庙以保证该寺不受破坏，即使是在全国服丧期间。

还有一个特别之处就是寺庙中只有4名祭司能触摸神像，而且祭司均需来自南印度。然而，由於尼泊尔於2009年发生了历史性的革命，尼泊尔的君主制已被推翻，随着民主化进程的推进，尼泊尔籍的祭司们称他们更适合守护神像，因为他们与南印度祭司有着同样渊博的学识，而且他们对加德满都独特多元的文化更为了解，而这正是南印度祭司所缺少的。

2001年6月16日，尼泊尔在帕舒帕蒂纳特庙为已故的比兰德拉国王、迪彭德拉国王举行哀悼仪式。新国王贾南德拉、柯伊拉腊首相及内阁成员参加了哀悼仪式。[2]

2015年尼泊尔地震，该寺庙幸存，建筑基本完好，但是几面墙被扭曲变形。数百具遇难者遗体在帕舒帕蒂纳特庙火化，死者骨灰顺巴格馬蒂河流走，巴格馬蒂河几乎被火化尸体的残留物堵塞。[3]

祭司  主庙正门，非印度教徒禁入。从后面可以看到湿婆的坐骑南迪的雕像

帕舒帕蒂纳特庙中的婆羅門被称为巴塔，而祭司长被称为Mool Bhatt或Raval。祭司长只答复尼泊尔国王的问话，并向国王定期报告寺庙的问题。这些进行表演的祭司全部来自南印度，而这些祭司中，最知名的一位是祭司长帕德马纳巴·沙斯特里·阿迪加（Raval Padmanabha Shastri Adiga，1927年－2005年）。他从1955年开始担任祭司，1967年成为祭司长。在任期内，他首次使用寺庙资金用於当地的发展。1993年退休后，他回到了故乡乌杜皮。

2009年骚乱事件

寺庙的祭司长自马拉王时代就均由南印度人担任，而这一点与寺庙中未证实的腐败问题成为尼泊尔人心中的症结。

2009年1月，在寺庙的祭司长被强行辞退後，尼泊尔共产党（毛主义）领导的政府“精心挑选”并任命了一名尼泊尔籍的祭司长，但并没有按照适当的程序实行。[4]此任命受到了寺庙中Bhandari们的非议，他们称自己并不反对此任命，但反对没有按照适当程序进行的任命。[5][6]法庭上，由於此任命决定遭到如此质疑，最高法院否决了此任命。[7][8]然而，政府无视这一裁决，继续这一任命决定，於是这种缺乏透明度的做法导致了公共暴力和抗议事件。尼共（毛主义）领导的半武装组织共产青年团（YCL）袭击了抗议者，导致多人受伤。[9]立法者和反对党激进分子也加入抗议者的行列，他们称他们会支持Bhandari们和其他抗议者。[10]而政府依然无视这一事件，继续其任命决定。

不过此后，因印度政客穆拉亚姆·辛格·亚达夫（Mulayam Singh Yadav）表达不满，而印度知名人士戈文达·阿胡贾（Govinda Ahuja）、阿米塔布·巴沙坎以及安尼尔·安巴尼也由於骚乱不能参观寺庙，尼泊尔政府迅速撤销了其决定，使印度祭司复职。[11]

^ Spiritual guides 互联网档案馆的存檔，存档日期2010-06-12. ^ 引证错误：没有为名为aidao的参考文献提供内容 ^ BBC：尼泊尔尸体火化昼夜不停 残留物堵塞河道，参考消息网，2015-04-30. [2015-05-02]. （原始内容存档于2016-03-04）.  ^ Indian Express. [2009-08-30]. （原始内容存档于2021-10-31）.  ^ Kantipur 互联网档案馆的存檔，存档日期2009-02-21. ^ Hindu Shrine: Pashupatinath in Nepal （页面存档备份，存于互联网档案馆） by Dirgha Raj Prasai，NewsBlaze ^ Sify. [2009-08-30]. （原始内容存档于2009-01-31）.  ^ Kantipur 互联网档案馆的存檔，存档日期2009-02-22. ^ Kantipur 互联网档案馆的存檔，存档日期2009-02-21. ^ eKantipur 互联网档案馆的存檔，存档日期2009-02-21. ^ Interfering with Pashupatinath （页面存档备份，存于互联网档案馆） by Prakash A. Raj，Kantipur