Мінарет Калян споруджений при соборній мечеті під час караханіда Арслан-хана, під керівництвом майстра зодчого уста Бако. Спочатку він мав на верхівці дерев'яний ліхтар. А невдовзі після завершення будівництва мінарет з невідомої причини впав. Його відбудували знову у 1127 році, цього разу повністю з випаленої цегли. Мінарет зберігся майже без змін.

Свого часу мінарет виконував кілька функцій: вежі при мечеті, звідки розспівувався азан (заклик мусульман до намазу); дозорної вежі; маяка, видимого далеко за межами міста.

У 1920 році під час штурму Бухари Червоною Армією мінарет постраждав від прицільного вогню артилерії, — снаряд зніс майже половину ліхтаря, який незабаром відновили, окрім двох верхніх ярусів карниза. Відтоді карниз складається із трьох ярусів сталактитів і висота його відповідно змінилася, що вплинуло на загальний вигляд мінарету.

У 1924 році відреставровані невелика частина стіни і мукарнаси мінарету. У 1960 році уста Очіл Бобомуродов відремонтував і укріпив підземну частину (фундамент і основа) мінарету. У 1997 році, до 2500-річчя Бухари, мінарет був капітально реконструйований і відреставрований кращими майстрами. У наступні роки в мінареті також проводилися невеликі реставраційні роботи.