Печера дуже давня, їй більше 30 000 років, вона була відома ще в Стародавній Греції, але потім забута і відкрита знову зовсім недавно, після землетрусу в 1951 році, коли впало одне із склепінь. Цього ж року пастух Іоаніс Петрохеліос зовсім випадково натрапив на надзвичайно дивну і красиву місцину з чудесним підземним озером. Для туристів вона була відкрита лише в 1963 році, після серії археологічних розкопок. Так як печера віками була ізольована, то в ній збереглося багато античних предметів. Це місце виявилося багатим на археологічні знахідки. Там були знайдені глиняні статуетки бога Пана і диски з зображеннями німф, що танцюють. Вчені припускають, що давньогрецькі жерці використовували печеру як святе місце. Експозиція знахідок з Мелісані в даний час зберігається в археологічному музеї міста Аргостолі.
Коментувати