З VIII століття по 973 рік ця територія входила до складу держави Раштракутів, з 973 року тут існувала держава роду Чалук'я, після розпаду якого, в 1189, утворилася держава Ядавів. Ядави були завойовані військами Делійського султанату в 1317 році.

На території сучасної Магараштри на початку XX століття знаходилися частини тодішніх державних утворень Бомбей, Гайдарабад і центральних провінцій. Після того, як Бомбей розширився на всю територію Магараштри, в 1956 р. його розділили по мовному кордону на штати Гуджарат і Магараштра.

У новітній історії в Магараштрі не раз траплялися збройні зіткнення між послідовниками індуїзму і мусульманами. Крім того не раз здійснювалися теракти проти іноземних підприємств.