Beppu Onsen (別府温泉) är en grupp varma källor i staden Beppu, Ōita i Japan. Beppu Onsen är uppdelad i åtta stora varma källor som kallas "Beppu Hatto".

Det viktigaste kännetecknet för Beppus varma källor är rikedomen på dess resurser. Volymen vatten som släpps ut är näst efter den i Yellowstone National Park i USA.

Det finns 2 909 varma källor i staden, och dessa står för mer än 10 % av de 27 644 varma källorna i Japan, enligt en undersökning gjord av miljöministeriet 2004. Statistik från Beppus stadshus visar att mer än 130 000 ton varmt källvatten forsar från marken varje dag. Detta är den näst största mängden varmvattenutsläpp i världen och den största mängden i Japan.