Choquequirao (verjetno iz kečuanske kovine chuqi, k'iraw jaslice, otroška posteljica) je inkovsko najdišče v južnem Peruju, po strukturi podobno in arhitekturo do Machu Picchuja. Ruševine so zgradbe in terase na nivojih nad in pod Sunch'u Pata, prisekanim vrhom hriba. Vrh hriba je bil starodavno poravnan in obdan s kamni, da je nastala ploščad 30 krat 50 m.

Choquequirao na nadmorski višini 3.050 metrov (10.010 ft) je v vznožju gorske verige Vilcabamba v okrožju Santa Teresa, provinca La Convención v regiji Cusco. Kompleks obsega 1.800 ha, od tega je 30–40 % izkopanega. Stran gleda na kanjon reke Apurimac, ki je visok 1450 metrov (4760 ft).

Do mesta se pride z dvodnevnim pohodom izven Cusca. Choquequirao je na vrhu prestižnega seznama najboljših regij Lonely Planet's Best in Travel 2017.