Unalaska er en liten by som ligger på øyene Unalaska Island og Amaknak Island på Aleutene i den vestlige delen av den amerikanske delstaten Alaska. Det er den største byen i folketellingsområdet Aleutians West Census Area.

Byens totale areal er 549,9 km² hvorav 262,4 km² er vann. I 2000 hadde byen 4 283 innbyggere.

Unalaska posisjon er 53°53′20″N 166°31′38″V og byen har fått sitt navn etter Unalaska Island. Navnet «Unalaska» er en amerikanisering av det russiske navnet «Ounalashka».

Russiske pelshandlere kom til Unalaska med Stepan Glotov og hans mannskap 1. august 1759.