シーネス地域には、ローマ、西ゴート王国、ヴァンダル族の痕跡が残る。

レコンキスタさなかの1217年、サンティアゴ・ド・カセンに本拠を置くポルトガルのサンティアゴ騎士団にシーネスが委ねられた。1362年、ポルトガル王ペドロ1世によって憲章が授けられ、1512年には新たな憲章がマヌエル1世から授けられた。

1460年代に、航海者ヴァスコ・ダ・ガマはシーネスで誕生した。

1834年、廃位されたミゲル1世はシーネスからオーストリアへ亡命した。

シーネスの近代史は、商業港が建設されて大型船が入港できるようになって始まった。1971年以降、産業の発展（石油化学工業など）と人口の増加が顕著になった。1997年には都市に昇格した。