L'origine de cette église « dans le pré » est un miracle qui s'est produit en 1738. Une jeune femme a vu pleurer une statue du Christ flagellé. Ce miracle a rapidement eu comme conséquence un pèlerinage. Une petite chapelle fut construite mais elle s'avéra bien vite trop petite pour accueillir les pèlerins venus de toute l'Europe.

Il a fallu que le chapitre de Steingaden prenne la décision de construire une nouvelle église. En 1743, l'abbé de Steingaden, Hyazinth Gassner, a choisi les metteurs en scène de cette image du Christ flagellé. Avec un goût tout bavarois, il a choisi le meilleur architecte et le meilleur sculpteur : Dominikus Zimmermann et Anton Sturm (en). Dominikus Zimmermann, l'un des représentants les plus doués de l'école de Wessobrunn, avait déjà fait ses preuves à travers toute la Bavière et arrivait à la fin de sa carrière. Ce fut pour lui une sorte de testament spirituel dans lequel il a donné le meilleur de lui-même. Avec la participation de son frère Johann Baptist, peintre à la Cour de Bavière, Dominikus Zimmermann construisit le nouvel édifice de 1743 à 1749. Reprenant le plan de Steinhausen, Zimmermann éleva une coupole ovale se prêtant à la décoration peinte et il donna à l'ensemble du vaisseau l'empreinte du style rococo. La sobriété extérieure de l'église contraste avec la magnificence de la travée ovale et du Choeur étroit et profond qui la prolonge. L'enduit à la chaux qui recouvre les murs fait ressortir les stucs, pour certains dorés, et les fresques aux splendides couleurs. La lumière pénètre abondamment par les ouvertures dont les formes, très caractéristiques du style de Zimmermann, contribuent à l'ornementation de l'ensemble, tant à l'intérieur qu'à l'extérieur. L'équilibre tout en finesse entre décoration et architecture donne une impression d'unité et de parfaite harmonie. Les parties basses, murs et piliers jumelés, délimitant la déambulatoire, comme c'est l'usage dans les églises de pèlerinage, sont volontairement peu ornées, puisqu'elles symbolisent la Terre. En revanche, dans les parties hautes symbolisant le Ciel, c'est une profusion de peintures, de stucs et autres éléments décoratifs. L'immense fresque de la coupole représente le retour du Christ, la porte encore fermée du Paradis et le trône sur lequel le Juge du Monde n'a pas encore pris place. Dans le Choeur, sont admirablement décorées les colonnes, les balustrades, les statues, les stucs dorés et les fresques. La grande peinture du retable montre le Christ fait Homme. L'Orgue de tribune et la chaire représentant, par la richesse et la finesse de leur ornementation, l'apogée du style rococo en Allemagne du sud.

La première pierre de die Wies a été posée le 31 août 1746. La consécration solennelle a été faite le 2 septembre 1749, seulement trois ans plus tard.

Au moment de la sécularisation au début du XIXe siècle, l'église était sur le point d'être vendue et démolie, toutefois en raison de l'initiative des fermiers locaux, elle a été sauvée. En 1983, on l'a ajoutée à la liste du patrimoine mondial de l'Unesco

De 1985 à 1991, la Wieskirche a fait l'objet d'une restauration importante.