مسجد سن پترزبورگ (به روسی: Санкт-Петербу́ргская мече́ть) مسجد معروفی در سن پترزبورگ، روسیه است که در هنگام پایان بنای آن در ۱۹۱۳ بزرگ‌ترین مسجد اروپا محسوب می‌شد. این مسجد با ارتفاع ۴۸ متری و ارتفاع ۳۹ متری گنبد در جنوب شهر سن پترزبورگ واقع است و به سادگی از روی پل‌های سه‌گانه بر روی رود نوا قابل رؤیت است.

سنگ بنای این مسجد در ۱۹۱۰ هنگام جشن بیست و پنجمین سالگرد خلافت عبدالاحد خان بر بخارا نهاده شد. تعداد مسلمانان سن پترزبورگ در آن دوران بالغ بر ۸٬۰۰۰ نفر بود. معمار آن نیکلای واسیلیف بود.