Desde 1580, el culto católico estuvo prohibido en las zonas controladas por la Unión de Utrecht.[1]​ Las comunidades solo podían reunirse de forma privada, sin que existiera ningún signo en el exterior de los edificios que pudieran delatarlos. De ahí surgió la idea de unir las buhardillas de tres casas contiguas para formar una pequeña iglesia completamente invisible desde el exterior.

El edificio se construyó para el comerciante católico Jan Hartman en 1661 y estuvo utilizándose para el culto desde 1663 a 1887, año en que se inauguró la nueva Iglesia de San Nicolás. En 1735 se amplió, añadiendo dos galerías superpuestas unidas al tejado mediante barras de hierro para aumentar el número de asientos disponibles. En 1888 se convirtió en museo. Actualmente es uno de los más antiguos de Ámsterdam.