Es muy probable que los orígenes del jardín sean anteriores al periodo safávida pues en la zona hay restos de jardines tan antiguos como la civilización Sialk;[1]​ algunas fuentes indican que partes del antiguo Bagh-e Fin, que también aprovechaba los manantiales de la zona y cuyas ruinas se hallan a 500 m del nuevo, pudieron haber sido reutilizadas en el nuevo complejo pero no se ha encontrado ninguna imagen o documento definitivo al respecto.

Los cimientos del jardín en su forma actual fueron construidos bajo el reinado de Abbas I de Persia (1571-1629), como un bagh tradicional en la región de Fin, localizada a pocos kilómetros al suroeste de Kashan.[2]​

El jardín siguió desarrollándose durante la dinastía safávida, hasta Abbas II de Persia (1633-1666). Se hizo famoso durante el reinado de Fath Alí Sah y fue ampliado considerablemente.

El jardín sufrió con posterioridad un abandono cada vez mayor y recibió daños en varias ocasiones hasta que, en 1935, fue incluido en la lista de tesoros nacionales de Irán.[1]​ Bagh-e Fin fue propuesto para la lista provisional de la Unesco el 8 de septiembre de 2007.[1]​ Finalmente, el 27 de junio de 2011, este y otros jardines representativos fueron inscritos en la lista de Patrimonio de la Humanidad bajo la denominación común de El jardín persa.[3]​