El castillo de Bojnice se mencionó por primera vez en registros escritos en el año 1113, en un documento que se encuentra en la abadía de Zobor. Originalmente construido como un fuerte de madera, fue reemplazado progresivamente por piedra, y las paredes exteriores se moldearon de acuerdo con el terreno rocoso irregular. Su primer propietario fue el noble húngaro Mateo III Csák, quien lo recibió en 1302 de manos del rey Ladislao V de Hungría. Tiempo después, en el siglo XV, fue propiedad del rey Matías Corvino de Hungría , quien se la dio a su hijo ilegítimo Juan Corvino en 1489. A Matías le gustaba visitar Bojnice, y fue aquí donde trabajó en sus decretos reales. Solía ​​dictarlos bajo un tilo, que ahora se conoce como el "Tilo del rey Matías". Después de su muerte, el castillo pasó a ser propiedad de la familia Zápolya, una familia noble húngara. Los Thurzós, la familia más rica del norte del Reino de Hungría, adquirieron el castillo en 1528 y emprendieron su importante reconstrucción. La antigua fortaleza se convirtió en un castillo renacentista. A partir de 1646, los propietarios del castillo fueron los Pálffy, quienes continuaron reconstruyéndolo.

Finalmente, el último propietario famoso del castillo de la familia Pálffy, el conde húngaro János Ferenc Pálffy (1829 - 1908), realizó una compleja reconstrucción romántica de 1888 a 1910 y creó la imitación actual de los castillos franceses del valle del Loira. No solo hizo construir el castillo, sino que también fue el arquitecto y diseñador gráfico. Utilizó su gusto artístico y su amor por coleccionar obras de arte. Fue uno de los mayores coleccionistas de antigüedades, tapices, pinturas y esculturas de su çepoca. Después de su muerte y largas disputas, sus herederos vendieron muchas obras de arte preciosas del castillo y luego, el 25 de febrero de 1939, vendieron el castillo, el balneario y las tierras circundantes al empresario checo Jan Antonín Baťa (propietario de la empresa de calzado bata ).

Después de 1945, cuando el gobierno checoslovaco confiscó la propiedad de Baťa, el castillo se convirtió en la sede de varias instituciones estatales. El 9 de mayo de 1950 se produjo un incendio en el castillo, pero fue reconstruido a expensas del gobierno. Después de esta reconstrucción, aquí se abrió un museo especializado en la documentación y presentación de la era de los neoestilos arquitectónicos. El Museo Bojnice es ahora parte del Museo Nacional Eslovaco en la actualidad.