En el medioevo la antigua iglesia de Skagen fue la iglesia más grande de la región de Vendsyssel. En la actualidad solo se conserva la torre de la iglesia, que se eleva por sobre las dunas.

La iglesia es mencionada por primera vez en relación con un barco de la liga Hanseática que encalla en Skagen el 31 de marzo de 1387.[1]​[2]​ El primer día se recuperaron 861 piezas de tela y fueron llevadas a la iglesia más cercana. Al día siguiente el sacerdote, Mr. Bernhard, lleva otros siete bultos con tela a la iglesia de Skagen. La reina Margarita I de Dinamarca recibe 400 piezas de tela, y en 1394 paga 320 nobles a guisa de restitución si bien los comerciantes declaran que el valor de las telas es 2,750 nobles. El sacerdote guardó siete bultos de telas pero juró “por su dignidad como sacerdote informar al rey y la reina cuantas piezas de tela contienen”.[3]​

La iglesia era propiedad de la Corona danesa hasta 1459, cuando su propiedad fue transferida al Hospital del Espíritu Santo, Aalborg.[1]​

La arena comenzó a desplazarse desde Råbjerg Mile hacia el 1600, cuando la zona que rodeaba a la iglesia fue afectada por la desertificación que destruyó los campos;[1]​ sepultó la villa vecina (cerca de Skagen)[4]​ y llegó a la iglesia a finales del siglo XVIII.[5]​ Esta cobertura de arena del suelo ocurrió en muchas zonas costeras alrededor del Mar del Norte entre 1400 y 1800, afectando a Escocia, Dinamarca, y Holanda; en la década de 1690 dos eventos de estas características ocurren en Escocia, y la desertificación de la zona de Skagen tuvo lugar durante dos siglos.[4]​ Con motivo del Gran día de plegarias (festividad religiosa dinamarquesa celebrada el cuarto viernes después de Pascua) en 1775, la puerta de la iglesia debió ser despejada de arena por la congregación para poder ingresar a la iglesia, y durante los siguientes 20 años, los habitantes de Skagener lucharon para mantener a la iglesia libre de arena, sin que se les permitiera cerrarla. Las decoraciones internas fueron quitadas fueron vendidos. En 1795 la iglesia fue cerrada por decreto real y el edificio principal de la iglesia fue demolido.[1]​[6]​ El cáliz, los candelabros, y una campana fueron utilizados en la nueva iglesia de Skagen construida por C. F. Hansen en 1841.[7]​[8]​

Según información existente el último funeral realizado en el camposanto se realizó en 1801 o en 1810.[7]​ A finales del siglo XIX el Museo Nacional de Dinamarca, que es el propietario del sitio en la actualidad, llevó a cabo una pequeña excavación cerca de la torre. El sitio de la nave nunca fue excavado. Se cree que el piso, el altar, la pila bautismal se encuentran aún enterrados bajo la arena.[7]​ Todo lo que queda visible de la antigua iglesia y de la villa ahora sepultada por la arena es la torre blanqueada de la iglesia, la cual se ha mantenido como un hito de ayuda a la navegación.[4]​[8]​

La torre ha sido un edificio histórico reconocido desde antes de 1937,[9]​ y es una iglesia dinamarquesa muy conocida.[1]​[10]​ Su torre llamó la atención de Hans Christian Andersen, quien usó la iglesia como escenario para su "En Historie fra Klitterne".[11]​

↑ a b c d e Error en la cita: Etiqueta <ref> no válida; no se ha definido el contenido de las referencias llamadas kirkehistorie ↑ Etting, Vivian (2004). Queen Margrete I, 1353–1412: And the Founding of the Nordic Union. BRILL. p. 74. ISBN 9789004136526.  ↑ Etting, Vivian (2004). Queen Margrete I, 1353–1412: And the Founding of the Nordic Union. BRILL. pp. 74-75. ISBN 9789004136526.  ↑ a b c Lamb, Hubert (2013). Weather, Climate and Human Affairs: A Book of Essays and Other Papers. Routledge. p. 119. ISBN 9781136639616.  ↑ «Den Tilsandede Kirke» (en danish). Visit Denmark. Consultado el 6 de septiembre de 2013.  ↑ Osborne, Caroline; Mouritsen, Lone (2010). The Rough Guide to Denmark. Penguin. p. 261. ISBN 9781848369627.  ↑ a b c «Skagen kirke: Den tilsandede kirke» (en danish). Diocese of Aalborg. 2013. Consultado el 6 de septiembre de 2013.  ↑ a b «Skagen Kirke» (en danish). Folkekirken.dk. Archivado desde el original el 27 de septiembre de 2013. Consultado el 6 de septiembre de 2013.  ↑ «Skagen gamle kirkeruin». Kulturstyrelsen, Kulturministriet (Danish Agency for Culture, Danish Ministry of Culture). Consultado el 15 de septiembre de 2013.  ↑ Lawson, Kristan; Rufus, Anneli S. (1999). Weird Europe: A Guide to Bizarre, Macabre, and Just Plain Weird Sights. Macmillan. p. 59. ISBN 9780312198732.  ↑ Andersen, Hans Christian (2011). The Complete Fairy Tales and Stories. Erik Christian Haugaard (trans.). Random House. p. 1085. ISBN 9780307777898.