Patagonien er et område i Sydamerika øst for Andesbjergene.

Størsteparten ligger syd for Rio Negro (41°S). På vestsiden af Andesbjergene dækker Patagonien området syd for (42°S).

Den chilenske del af Patagonien omfatter den sydlige del af Los Lagos samt regionerne Aisén og Magallanes.

Øst for Andesbjergene dækker Patagonien fire provinser i Argentina, Neuquén, Río Negro, Chubut og Santa Cruz.

Den sydlige del af Patagonien udgøres af Ildlandet.