El primer testimoni documental sobre el poble data del 1283 en un document sobre els impostos que pagaven els habitants de set pobles i, per tant, es creu que va ser fundat en algun moment entre el 1224 i el 1283 pels saxons transsilvans. L'assentament del poble es va convertir ràpidament en una important ciutat mercant i el 1510 Biertan donava suport a una població d'uns 5.000 habitants. Entre 1468 i el segle xvi es va construir i desenvolupar una petita església fortificada (die Kirchenburg).

Després del període medieval, la ciutat va caure en importància amb l'ascens de la veïna Sighișoara (o Schäßburg en alemany), Sibiu (Hermannstadt) i Mediaș (Mediasch).

En el cens de 1930 Biertan tenia 2.331 habitants, dels quals 1228 eren saxons de Transsilvània. Durant la Segona Guerra Mundial molts homes van ser reclutats a l'exèrcit romanès i més tard a la Waffen-SS. Després de la guerra, molts saxons transsilvans van ser expulsats de la regió. Després del col·lapse del comunisme el 1990, molts més van marxar a Alemanya.

Avui tot el municipi que inclou Biertan té una població d'uns 2.500 habitants i només el poble de Biertan té unes 1.600 persones. És un dels pobles més visitats de Transsilvània, essent el lloc històricament important de la reunió anual dels saxons de Transsilvània, molts dels quals ara viuen a Alemanya.