ميناء هامبورغ (بالألمانية: Hamburger Hafen) هو أكبر ميناء في ألمانيا وثالث أكبر ميناء في أوروبا ويحتل المرتبة 18 في قائمة أكبر موانئ الحاويات في العالم. بالرغم من أن مدينة هامبورغ لا تقع مباشرة على البحر، وإنما موجودة على نهر الإلبه، إلا ان النهر عريض نسبيا وصالح للملاحة، بالإضافة إلى ان المدينة قريبة من بحر الشمال. كل ذلك مهّد لها أن تصير أحد أكبر الموانئ. يقع الميناء في وسط المدينة على بعد 110 كم من مصب النهر في بحر الشمال. في عام 2004، تم إفراغ وتحميل 7 ملايين حاوية. الميناء هو الأول عالميا في تحميل البن.

لقد دخلت الميناء 11700 سفينة عام 2002. هناك مصاف ل 320 سفينة، منها مصاف ل 38 سفينة حاويات وسفن شحن كبيرة كما انه هناك خطط لعمل أرصفة أخرى تسع لتسع سفن حاويات أخرى. يوجد أيضا سفن حفر تعمل طوال العام لزيادة 13 متر منعمق النهر لدخول السفن، وخاصة الكبيرة منهم. حوالي 9000 رحلة شحن سنويًا تتم بالميناء، وما يقرب من 300 رصيف بإجمالي 43 كيلومترًا من جدران الرصيف الطويلة للسفن العابرة للمحيطات، أكثر من 2300 قطار شحن في الأسبوع، أربع محطات حديثة للحاويات، ثلاث محطات للرحلات البحرية، وحوالي 50 مرفقًا متخصصًا لإعادة الشحن لشحنات Ro-Ro وشحنات البضائع العامة والبضائع السائبة من جميع الأنواع، كما يوجد قرابة 7300 شركة لوجستية داخل حدود المدينة - هذه ليست سوى بعض العوامل التي تجعل ميناء هامبورغ أحد أكثر الموانئ العالمية مرونة وكفاءة في العالم. في عام 2017، عبر 136.5 مليون طن من البضائع رصيف الميناء الأكبر في ألمانيا. مع أن الميناء يقع بمسافة ليست بالقليلة في عمق الأراضي الألمانية (110 كم)، إلا أنه يجب على المرء عدم نسيان رخص النقل البحري مقارنة مع النقل البري للبضائع عند ايصالها لهامبورغ من ساحل بحر الشمال. المنطقة الحرة في الميناء هي أحد مزاياه أيضا. البضائع التي تأتي مع السفن، لا يتم جمركتها إلا عند دخولها للأراضي الألمانية أي انه يمكن أن يتم إعادة تصديرها إلى الخارج بدون أن تتم جمركتها. المنطقة الحرة مسيجة ويوجد نقاط تفتيش جمركية على مداخلها ومخارجها. لهذا الغرض، تم بناء مدينة التخزين داخل حدود المنطقة الحرة.