كنيسة العظام (بالإنجليزية: Chapel of Bones)‏ هي واحدة من أبرز المعالم الأثرية المعروفة في إيفورا، البرتغال. إنها كنيسة صغيرة داخلية تقع بجوار مدخل كنيسة القديس فرنسيس. تحصل الكنيسة على اسمها لأن الجدران الداخلية مغطاة ومزينة بجماجم وعظام بشرية.