圣若望主教座堂 (馬爾他語：Kon-Katidral ta’ San Ġwann)是罗马天主教在马耳他的主教座堂之一，也是首都瓦莱塔的地标建筑之一。它是由马耳他骑士团兴建于1573年到1578年，为骑士团的修道院教堂，后来随着时间的推移，取得了与姆迪纳总主教座堂平等的地位。在19世纪20年代，马耳他主教获准在姆迪纳之外，可使用圣若望堂作为另一个主教座堂。教堂的设计者是马耳他军事建筑师卡萨尔，他也设计了瓦莱塔其他一些重要建筑。