卡盖拉河和Rurubu河汇流处

从石器时代开始尼罗河就已经是古埃及文明的命脉。埃及大多数居民和所有城市位于阿斯旺以北的尼罗河畔。前八千年以前由于气候变化或者由于对干燥草原的过分畜牧利用导致尼罗河沿岸沙漠化，迫使人类越来越集中在河谷两岸生活，了一个高度中央集权的农业经济社会的形成。

在有史纪录中，尼罗河曾于829年[1][2]和1010年[3]两次封冻。

在埃及尼罗河也拥有精神意义。在古埃及神话中专门有一位对尼罗河年度洪水负责的神哈比。他和法老均控制尼罗河的洪水。同时尼罗河也被看作是生命、死亡和死后生命的一条通道。东方被看作是出生和生长的地方，西方则是死亡的地方，每天太阳神拉都经历出生、死亡和再生。因为埃及人相信要获得死后再生，他们必须被埋葬在代表死亡的一方，因此所有的坟墓均位于尼罗河西岸。

 

根据希羅多德的描写绘制的公元前450年左右被居住的世界的地图

希腊历史学家希羅多德称“埃及是尼罗河的赠礼”。没有尼罗河水的灌溉埃及文明可能只会昙花一现。尼罗河为一个旺盛的文明和它三千多年不衰的历史提供了一切条件。

希腊人和罗马人均试图寻找尼罗河的源头，但都没有成功。因此在古典希腊和罗马的图像中尼罗河总是被显示为一名将头和面用枝叶蒙盖起来的男神。阿伽撒尔基德斯报道说托勒密二世派遣了一支远征军，这支军队至少能够确定青尼罗河夏季的洪水是由埃塞俄比亚高原上的雨季导致的，可以确定的是这支远征军最远到达了麦罗埃，但是在古代没有任何欧洲人到达了塔纳湖。

直到15、16世纪欧洲人对于尼罗河河源所知甚少。15、16世纪里欧洲人来到了埃塞俄比亚，见到了塔纳湖，并且找到了湖南山里青尼罗河的源头。詹姆斯·布鲁斯自称是第一个到达青尼罗河源头的人，但是现代历史学家认为耶稣会教士佩德罗·波埃兹（Pedro Páez）是第一名找到青尼罗河源的人。不过从15世纪末开始欧洲人就已经居住在埃塞俄比亚了，因此很可能他们中有人在波埃兹之前就已经到达了青尼罗河河源，但是无法将这个消息传出埃塞俄比亚。

对白尼罗河的知识就更少了。古代错将尼日尔河当作是白尼罗河的上游。比如老普林尼称尼罗河源于“下毛里塔尼亚的山里”，在地面上流过“许多天”的距离，然后转入地下，然后又出现到地面上，形成一个巨大的湖，此后又沉到沙漠下，流过“20天距离，直到埃塞俄比亚附近”。[4]

1858年英国探险家约翰·汉宁·斯皮克在随同理查德·弗朗西斯·伯顿探查中非时到达了维多利亚湖的南岸。他是第一个看到维多利亚湖的欧洲人。斯皮克在第一次看到这个大湖时就相信他发现了尼罗河的源头。他以维多利亚女王命名这个湖。伯顿这个时候正在坦噶尼喀湖边养病，他对斯皮克称发现了尼罗河的河源非常生气。伯顿认为这个问题还没有解决。两人的公开争吵很快就普及到了当时整个科学界，而且还引起了许多其他探险家的兴趣。他们当中有声称证实，也有声称否定了斯皮克的发现的人。英国著名探险家和传教士大卫·利文斯顿未能证实斯皮克的发现，他向西跑得太远了，进入了刚果河的流域。最后美国探险家亨利·莫頓·史丹利环绕了维多利亚湖，在其北岸发现了瑞本瀑布，从而证实了斯皮克的发现。

2004年1月17日南非人亨德利·柯慈带领的白尼罗河探险队从乌干达的尼罗河河源出发。他们利用了四个月又两星期沿尼罗河一直到达埃及罗塞塔尼罗河注入地中海处。國家地理學會于2005年末发行了一部题为《最长之河》的关于这次探险的纪录片。

2004年4月28日地质学家Pasquale Scaturro和纪录片制片人戈登·布朗一起从埃塞俄比亚的塔纳湖一直到达地中海畔亚历山大港海滨，成为第一次沿青尼罗河全程的人。虽然还有其他人参加了这次探险，但是他们两人是唯一走过全程的人。他们使用了一台IMAX和两台手提摄影机，将他们的探险拍成了名为《神秘的尼罗河》的IMAX电影。同时他们还出版了一本同名的书。他们在大多数路上使用机动的船。2005年1月29日加拿大人莱斯·吉克林和新西兰人马克·田纳成为第一个完全使用人力划桨走过尼罗河全程的人。

2005年4月30日一支由南非人彼得·梅瑞蒂特和亨德利·柯慈带领的探险队首次行过了尼罗河最远的支流，从卢旺达纽恩威森林发源的卡盖拉河。

2006年3月31日，一支由三名英國及紐西蘭人所組成探險隊在麦克格里格的带领下宣布，他們從維多利亞湖再向上溯源，最後發現一個位於盧旺達纽恩威森林的源頭2°16′55.92″S 29°19′52.32″E / 2.2822000°S 29.3312000°E / -2.2822000; 29.3312000，長度約增加100多公里。