Kootenay Millî Parkı (İngilizce: Kootenay National Park), Kanada'da Rocky Dağları'nda bulunan bir millî parktır. Park, Britanya Kolumbiyası sınırları içerisinde yer almaktadır ve Kanada Kayalık Dağları'nın Kootenay ve Park sırtları ile Kootenay ve Vermillion nehirlerini kapsamaktadır. Kootenay, Jasper, Yoho ve Banff millî parkları ile Britanya Kolumbiyası'ndaki üç eyalet parkı olan Hamber Eyalet Parkı, Assiniboine Eyalet Parkı ve Robson Dağı Eyalet Parkı ile birlikte UNESCO Dünya Mirası listesine dahil olan Kanada Kayalık Dağları Millî Parkı'nı oluşturmaktadır.

Parkın başlıca görülecek yerleri arasında Radyum Kaplıcaları, Paint Pots, Sinclair Kanyonu, Marble Kanyonu ve Olive Gölü bulunmaktadır.