Город Бонифачо был основан около 830 года пизанцем Бонифачио[1].

В войнах между корсиканцами, пизанцами, генуэзцами и арагонцами Бонифачо играл важную роль. В особенности для генуэзцев он был необходим как оплот для их торговли в тамошних водах. Ещё в 1554 году, когда после продолжительной бомбардировки город был передан соединенному войску французов и турок, он считался самым укреплённым городом Корсики[1].

Вплоть до первой половины XX века основными занятиями жителей острова были виноделие, ловля устриц, тунца и кораллов, торговля пробкой, воском, кожей, оливковым маслом, лесом и т. д.[1]

В настоящее время значительную часть экономики острова занимает туризм. Главными достопримечательностями, свидетельствующими о былом величии города Бонифачо, являются церкви Санта-Мария-Маджиоре, Сан-Франческо (XIV век), Сан-Доминико (в готическом стиле, окончена в 1343 году) и госпиталь, основанный около 1300 года[1].