Čilojės bažnyčios – išskirtinės architektūros bažnyčių kompleksas Čilėje, Čilojės saloje. Sudaro medinės, liaudies architektūros bruožų bažnyčios, pastatytos XVIII-XX a. pr. Bažnyčios pastatytos steigiantis jėzuitų, Čilojėje vykdžiusių vietinių gyventojų evangelizaciją, misijoms. Bažnyčių statybai naudota vietinė arba Palenos provincijos miškų mediena (notofagai, spygliuočių mediena, luma).

Iš viso buvo pastatyta ~150 bažnyčių, tačiau nemaža dalis jų sunyko, buvo išgriautos. Nuo 2000 m. 16 Čilojės medinių bažnyčių yra įtrauktos į UNESCO pasaulio paveldo sąrašą.