Non lontano di Biertan, in un bosco a circa 5 km, è stato scoperto nel 1775 un donarium attribuito al IV secolo, conosciuto come il Donario di Biertan. Questo oggetto dimostrerebbe l'esistenza di una popolazione cristiana di lingua latina in Dacia dopo il ritiro romano del 275 d.c. e si trova nel Museo Brukenthal di Sibiu. Realizzato in bronzo a forma di labaro, ha l'iscrizione latina EGO ZENOVIUS VOTUM POSVI (Io, Zenovius, ho offerto questo dono).

Si ritiene che il villaggio sia stato fondato fra 1224 e 1283 dai Sassoni transilvani. È cresciuto rapidamente come centro commerciale commerciale raggiungendo i cinquemila abitanti all'inizio del sedicesimo secolo. Nel 1572 il prete Lucas Unglerus (originario di Biertan) fu nominato vescovo della Transilvania: Biertan divenne la sede dell'episcopato protestante per tre secoli ed acquistò così un notevole prestigio. La diocesi di Biertan cessò di esistere nel 1867 dopo la morte del vescovo Georg Paul Binder.

Nel 1704, benché dotata di forti difese, la città fu colta di sorpresa e devastata dai ribelli guidati da György Dózsa. Dopo la caduta del muro di Berlino, negli anni novanta del secolo scorso, gran parte della popolazione tedesca, protagonista per secoli della storia di Biertan, si è trasferita in Germania.