L'attuale Museu Faller de Valencia è installato dal 1971 nell'antico Convento della Casa Missió de Sant Vicenç de Paül, terminato nel 1831, motivo per cui conserva parte di una struttura di corridoi e vecchie celle. In seguito ebbe molteplici usi, come prigione, caserma o magazzino. Il Museo Faller è stato riabilitato e ristrutturato all'inizio degli anni Novanta del secolo xx, per essere riaperto nel 1995. Nel 2016 il Museo Faller è stato approvato come Museo ufficiale della Generalitat Valenciana, in via di nuova ristrutturazione nei suoi approcci museologico e museografico. Una delle novità di questa ristrutturazione è stata l'inaugurazione della sala espositiva temporanea "Josep Alarte", dedicata alle mostre antologiche dell'opera degli artisti autunnali.