Malindi mecset egy mecset Stone Townban, Zanzibárban, Tanzániában, a kikötő közelében. Az 1830-as évekből származik, de lehetséges, hogy egy régebbi mecset helyére építették, amely a 17. századból vagy korábban származhatott. Egyes útikalauzok a 15. századi eredetet állítják.

A jelenlegi mecsetet 1834-1835/1250 között építtette Muhammad ben Abdulkadir al-Mansaby a szomáliai Benadir-partról. Gazdag kereskedő volt Zanzibárban az 1820-as és az 1840-es évek között. Az épületet kétszer bővítették 1841-ben és 1890-ben.

Néhány szokatlan építészeti eleme van, köztük egy kúp alakú minaret (egyike a három ilyen alakú minaretnek Kelet-Afrikában) és egy négyzet alakú emelvény.