L'île était à l'époque maya un lieu de culte d'Ix Chel, la déesse de la Lune et de la fécondité. C'est en voyant de nombreux temples et de statues de femmes, que Francisco Hernández de Córdoba un conquistador espagnol la nomma Isla Mujeres, « île des femmes » en français. Couvrant 800m2, les 500 statues immergées en mer (entre 4 et 8 m de profondeur) depuis 2009 sont l'œuvre du sculpteur britannique Jason deCaires Taylor. Ce musée sous-marin s'appelle le MUSA (Museo Subacuático de Arte). Il est divisé en deux parties: le salon Machones a une profondeur de huit mètres et convient aussi bien aux plongeurs en scaphandre autonome qu'aux plongeurs en apnée. Le salon Nizuc (-4 m de profondeur) n'est autorisé que pour la plongée en apnée.