Malindi mešita je mešita v Stone Town, Zanzibar, Tanzanie, která se nachází v blízkosti přístavu. Pochází ze 30. let 19. století, ale bylo možné jej postavit na místě starší mešity, která mohla pocházet ze 17. století nebo dříve. Někteří cestovní průvodci uvádějí původ v 15. století.

Současnou mešitu postavil v letech 1834–1835/1250 AH Muhammad ben Abdulkadir al-Mansaby z pobřeží Benadir v Somálsku. Byl bohatým obchodníkem na Zanzibaru během 20. až 40. let 19. století. Budova byla dvakrát rozšířena v letech 1841 a 1890.

Má některé neobvyklé architektonické prvky, včetně kuželovitého minaretu (jeden z pouhých tří minaretů tohoto tvaru ve východní Africe) a čtvercové platformy.