بعد وفاة الإمبراطور ميجي عام 1912 أقر البرلمان الياباني قرار لتخليد ذكرى الإمبراطور في إصلاح ميجي. تم اختيار مكان الضريح في حديقة كان الإمبراطور والإمبراطور يزورانها في السابق. بدأت عمليات البناء عام 1915 واستمرت حتى عام 1921، وانتهت أعمال بناء الأراضي رسمياً عام 1926. دمر مبنى الضريح الرئيسي أثناء القصف الجوي لطوكيو في الحرب العالمية الثانية، ثم تم إعادة بناءه من التمويل العام في أكتوبر 1958.